Parallelisierung der Next Reaction Method für zell-biologische Simulation

Hauptmann, Felix (2019) Parallelisierung der Next Reaction Method für zell-biologische Simulation. Bachelor thesis, Institute of Computer Science, University of Rostock.

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Abstract

Simulationen chemischer und zell-biologischer Systeme spielen eine große Rolle in der heutigen Forschung. Umso wichtiger wird es die Laufzeit von Simulationsalgorithmen auf immer größer werdenden Modellen unter Kontrolle zu halten bzw. zu verringern. Der stärker werdende Trend der Hardwareentwickler, Prozessoren mit immer größerer Anzahl von Kernen herzustellen, schafft die Gelegenheit diese Simulationsalgorithmen parallel durchzuführen und deren Leistung zu steigern. Ziel dieser Arbeit ist es, Konzepte für die Parallelisierung der Next Reaction Method zu entwickeln. Die Implementierung dieser Konzepte und die Durchführung von Experimenten zur Festellung der Korrektheit des Verfahren und dessen Performance werden behandelt. Anschließend wird die Tauglichkeit des arallelisierungskonzeptes für ML-Rules bewertet.